Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eri2Q5BKS4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Eri2Q5BKS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eri2Q5BKS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms