Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndufaf2Q59J78 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf2Q59J78 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufaf2Q59J78 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms