Protein–RNA interactions for Protein: Q495M9

USH1G, Usher syndrome type-1G protein, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1GQ495M9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USH1GQ495M9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USH1GQ495M9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USH1GQ495M9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USH1GQ495M9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USH1GQ495M9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186 ms