Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg1lQ3V384 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Afg1lQ3V384 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg1lQ3V384 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms