Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Clpsl2Q3UW21 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clpsl2Q3UW21 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clpsl2Q3UW21 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clpsl2Q3UW21 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clpsl2Q3UW21 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clpsl2Q3UW21 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clpsl2Q3UW21 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clpsl2Q3UW21 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clpsl2Q3UW21 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clpsl2Q3UW21 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clpsl2Q3UW21 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clpsl2Q3UW21 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms