Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnga4Q3UW12 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnga4Q3UW12 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga4Q3UW12 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga4Q3UW12 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms