Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp560Q3URI6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp560Q3URI6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms