Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsf3Q3URE1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acsf3Q3URE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acsf3Q3URE1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acsf3Q3URE1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms