Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd9Q3UQU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd9Q3UQU0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd9Q3UQU0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms