Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnrc6cQ3UHC0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6cQ3UHC0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms