Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TraddQ3U0V2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TraddQ3U0V2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TraddQ3U0V2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TraddQ3U0V2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms