Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rufy4Q3TYX8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rufy4Q3TYX8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rufy4Q3TYX8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms