Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shcbp1lQ3TTP0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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