Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms