Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim43aQ3TL54 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim43aQ3TL54 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43aQ3TL54 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms