Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRK1Q38SD2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRK1Q38SD2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRK1Q38SD2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRK1Q38SD2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRK1Q38SD2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRK1Q38SD2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRK1Q38SD2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRK1Q38SD2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms