Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp8Q2V6D6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp8Q2V6D6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms