Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC96Q2M329 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC96Q2M329 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC96Q2M329 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms