Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SWI5Q1ZZU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SWI5Q1ZZU3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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