Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TXNRD1Q16881 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TXNRD1Q16881 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TXNRD1Q16881 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
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