Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF239Q16600 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF239Q16600 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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