Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF56Q15929 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF56Q15929 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms