Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA1EQ15878 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1EQ15878 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1EQ15878 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA1EQ15878 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms