Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD8Q15843 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD8Q15843 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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