Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCOA1Q15788 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NCOA1Q15788 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCOA1Q15788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
NCOA1Q15788 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
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