Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWIST1Q15672 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TWIST1Q15672 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TWIST1Q15672 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TWIST1Q15672 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TWIST1Q15672 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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