Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAM1Q15629 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM1Q15629 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAM1Q15629 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAM1Q15629 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAM1Q15629 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM1Q15629 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM1Q15629 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAM1Q15629 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM1Q15629 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM1Q15629 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAM1Q15629 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM1Q15629 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM1Q15629 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM1Q15629 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM1Q15629 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM1Q15629 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM1Q15629 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM1Q15629 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM1Q15629 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM1Q15629 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM1Q15629 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM1Q15629 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM1Q15629 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM1Q15629 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM1Q15629 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM1Q15629 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM1Q15629 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM1Q15629 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM1Q15629 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM1Q15629 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM1Q15629 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM1Q15629 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM1Q15629 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM1Q15629 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM1Q15629 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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