Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1CQ15572 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF1CQ15572 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF1CQ15572 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
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