Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABEP1Q15276 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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RABEP1Q15276 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RABEP1Q15276 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RABEP1Q15276 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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