Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NKX1-1Q15270 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NKX1-1Q15270 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NKX1-1Q15270 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NKX1-1Q15270 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms