Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CAPRIN1Q14444 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPRIN1Q14444 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN1Q14444 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms