Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CDK13Q14004 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK13Q14004 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CDK13Q14004 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
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