Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1CQ13936 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1CQ13936 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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