Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53BP1Q12888 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53BP1Q12888 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53BP1Q12888 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 542 ms