Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
GRIN2AQ12879 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.31■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.31■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.26■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
GRIN2AQ12879 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
GRIN2AQ12879 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
GRIN2AQ12879 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms