Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ppp4r2Q0VGB7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp4r2Q0VGB7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp4r2Q0VGB7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms