Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim24Q0VG18 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim24Q0VG18 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim24Q0VG18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms