Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col19a1Q0VF58 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col19a1Q0VF58 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col19a1Q0VF58 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms