Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc138Q0VF22 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc138Q0VF22 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms