Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StumQ0VBF8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175 ms