Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP4Q09028 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms