Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPIRE1Q08AE8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPIRE1Q08AE8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPIRE1Q08AE8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms