Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPOCK1Q08629 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms