Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col9a2Q07643 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col9a2Q07643 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col9a2Q07643 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms