Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFRSF9Q07011 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF9Q07011 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF9Q07011 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms