Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Caprin2Q05A80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caprin2Q05A80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.8 ms