Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnal1Q05A62 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnal1Q05A62 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnal1Q05A62 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms