Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNP2Q05952 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNP2Q05952 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNP2Q05952 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms