Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC18A2Q05940 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms