Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sox12Q04890 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sox12Q04890 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sox12Q04890 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sox12Q04890 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms